Западно-Казахстанский государственный медицинский университет имени Марата Оспанова осуществляет подготовку медицинских кадров на восьми факультетах: лечебном, педиатрическом, стоматологическом, медико-профилактическом, фармацевтическом, по подготовке специалистов со средним профессиональным образованием, повышения квалификации врачей (ФПК) и дополнительного медицинского и фармацевтического образования (ДМиФО).